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JBO竞博除了GEO和TCGA这些医学公开数据库也值得收藏一波!

发布日期:2023-09-20  来源:

  JBO竞博医学工作者在撰写论文的时候常常会用到大量数据,那这些引用的医学数据是从哪里来的呢?羡慕别人利用过公开的数据库来发表论文,而你却知道GEO和TCGA?

  全球卫生数据(GHDx)是一个全球卫生和人口数据的目录。GHDx的目标是帮助人们找到数据编目数据信息包括主题,通过提供链接数据提供者或解释如何获取数据,并且在我们允许的情况下,提供的数据直接下载。GHDx研究包括人口普查数据,调查、注册、指标和估计,行政健康数据和与健康有关财务数据。

  属于国家科技基础条件平台下的科学数据共享平台。2003年作为科技部科学数据共享工程重大项目立项,2010年通过科技部和财政部组织的平台认定转为运行服务,面向全社会开放提供服务。平台的总体目标是建立国家的人口与健康科学数据共享服务平台,为政府决策、人口健康、医疗卫生、人才培养、科技创新、产业发展和百姓健康提供权威、开放、便捷的数据共享和信息服务。

  提供各种经过同行评议的公共卫生数据信息,里面有很多已经发表的论文的原始数据。

  主要提供开放获取的磁共振影像数据,旨在使科学界免费使用神经影像数据集。通过编译和自由分发此多模式数据集,希望能够促进基础和临床神经科学方面的未来发现。

  DeepLesion由美国国立卫生研究院临床中心(NIHCC)的团队开发,是通过从他们自己的图片存档和通信系统中挖掘历史医学数据而开发的。这个新的数据集具有极大的潜力JBO竞博,将会大大促进计算机辅助检测(CADe)和计算机辅助诊断(CADx)领域的技术发展。该数据库中图像包括多种病变类型,包括肾脏病变,骨病变,肺结节和淋巴结肿大。缺乏多类别病变数据集,一直是开发能够检测多种病变类型的更通用CADe框架的主要障碍。而DeepLesion多类别病变数据集可以用来开发自动化放射诊断的CADx系统。DeepLesion数据集包含来自10,000多个病例研究的超过32,000个病变标注,现在是面向所有人可公开获得的最大的医学图像数据集。

  NITRC可提供有关神经信息学软件和数据。自2007年首次亮相以来,NITRC借助过去经常丢失或无视的研究软件和数据,帮助神经科学界做出了进一步发现。NITRC还提供对数据的免费访问,并允许按使用量付费的基于云的访问来获得无限的计算能力,从而以最小的启动和成本实现了全球科学合作。NITRC的内容包括:MR,PET / SPECT,CT,EEG / MEG,光学成像,临床神经成像,计算神经科学以及成像基因组学软件工具,数据和计算资源。

  这是一个阿尔茨海默病相关的数据库。ADNI将研究人员与研究数据联合起来,共同努力确定阿尔茨海默氏病(AD)的进展。ADNI研究人员收集,验证和利用数据,包括MRI和PET图像,遗传学,认知测试,CSF和血液生物标记物作为疾病的预测因子。北美ADNI研究的研究资源和数据可通过此网站获得,其中包括阿尔茨海默氏病患者,轻度认知障碍受试者和老年人对照。

  一个骨关节炎(OA)的数据库,该数据存储库提供对11年OAI纵向队列研究的数据和图像的访问 。这项研究记录了 整个疾病范围内的膝骨关节炎的自然病史,包括处于危险中的受试者,患有早期/临床前疾病,患有确定性OA的受试者以及患有晚期疾病的受试者。在OAI中,已经记录了膝OA的影像学,生化,遗传和危险标志物。将这些指标与结构和/或临床 结果进行比较可以使人们对预防和治疗这种使人衰弱的疾病有深入的了解。该OAI研究设计,措施,临床数据和DICOM图像都可以使用本网站下载。

  包括MIMIC-II,MIMIC-III,MIMIC-IV, eICU,PIC(儿科),HIRID数据库。其中使用较多的是MIMIC-III数据库。该数据库可以免费申请使用,内有贝斯以色列女执事医疗中心在2001年和2012年之间重症监护室超过四万病人的相关数据。数据库包含信息如人口统计学特征、床边生命体征的测量,实验室测试结果,各种操作、药物、影像报告和死亡指标。 现在利用这个数据库发文章的人很多。

  SEER肿瘤数据库是由美国国立癌症研究所(National Cancer Institute,NCI)建立,是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一,收集了大量医学的相关原始数据。数据库中的肿瘤可分为9类:乳腺、结肠&直肠、其他消化系统、女性生殖、淋巴&白血病、男性生殖、呼吸系统、泌尿系统及其它尚未确定的类型。临床数据记录中包括患者的注册编号、人口统计学特征、肿瘤特征、治疗方案、死亡原因等信息。

  NHBLI临床研究数据主要来源于最近70多年以来的流行病学研究和临床研究,包含来自于145家中心临床注册研究和观察性研究的数十万患者数据。临床注册研究的数据包含患者基线资料、中期随访信息、辅助研究以及预后资料(包含实验室检查);流行病学研究数据包含在整个观察周期内获得的所有监测结果。

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